La exploración y colonización prehistórica de la región cordillerana boscoso-lacustre de Patagonia Septentrional se encuentra representada en este Parque en los restos de dos asentamientos de grupos cazadores recolectores, ubicados en diferentes niveles altitudinales sobre el río Desaguadero: el Alero del Shamán y del Sendero de Interpretación. Estos dos sitios considerados de actividades limitadas, no de base residencial y actividades múltiples, se asocian al aprovechamiento de los diversos recursos del bosque, inscribiéndose en los momentos tardíos de la prehistoria regional. Los fechados realizados por las investigaciones en curso se remontan a 2200 y 1500 años antes del presente.
Es recurrente en estas ocupaciones la utilización de las paredes de los aleros como soporte para la ejecución de pinturas. Estas son comunes en sus estilos de grecas y de símbolos complicados al arte rupestre de la región norte de Patagonia. Los principales motivos expresados en estos sitios son: clepsidras, círculos concéntricos, cruciformes, cuadrados, rectángulos, laberintos y figuras humanas esquemáticas.
El visitante puede apreciar estos testimonios culturales en el Sendero de Interpretación especialmente habilitado a tal efecto.

MODO DE ACCESO. Se arriba desde la ciudad de Esquel, por la Ruta Nacional Nº 259 empalmando con la Ruta Provincial Nº 71, que atraviesa el área protegida en dirección norte-sur. Por este camino se arriba a Villa Futalaufquen, donde se ubica el Centro Administrativo del Parque Nacional. La Ruta continúa hacia el norte del Parque uniendo la Villa Futalaufquen con la Ruta Nacional Nº 258, rumbo a la Ciudad de El Bolsón.
Por avión se arriba al aeropuerto de Esquel, que dista 38 km del Parque. También se puede llegar por tren, con la famosa "Trochita", que une la estación Ingeniero Jacobacci con Esquel.

DATOS DE INTERES PARA EL VISITANTE. En la Villa Futalaufquen, dentro del Parque, se encuentra la Intendencia y el Centro de Visitantes, donde se podrá obtener la información que necesaria acerca del Parque y adquirir el permiso de pesca. Este centro poblado cuenta con estaciones de servicio y ofertas turísticas como casas de té, casas de regalos y hosterías. También en otros sitios del área protegida se ofrece alojamiento como cabañas y hosterías. De Puerto Limonao, a unos 4 km de la Intendencia, parte una excursión turística lacustre. Navega todo el Lago Futalaufquen para remontar el breve río Arrayanes. En el Lago Verde se desciende para caminar un corto trecho hasta otra embarcación, en la que se continúa navegando por el Lago Menéndez. Se bordea la Isla Grande y poco después se pueden admirar los imponentes ventisqueros del Cerro Torrecillas. Finalmente, se llega a la cabecera del Brazo Norte del Lago Menéndez donde, mediante adecuadas sendas, pasarelas y escaleras, se puede recorrer el majestuoso "Alerzal".
Diferentes y atractivos lugares de este Parque Nacional pueden ser recorridos a través de más de veinte senderos peatonales, numerosos caminos vehiculares y sendas habilitadas para cabalgata y ciclismo. Se describen a continuación algunos de los senderos que permiten recorrer hermosos lugares de este Parque Nacional:

Sendero Cinco Saltos: la ascensión tarda dos horas y media partiendo desde Puerto Limonao, llegando hasta un mirador de los saltos de agua del arroyo Los Pumas. Presenta una dificultad media de ascenso.

Sendero Cerro Alto El Dedal: requiere 5 ó 6 horas de ascenso, partiendo desde Puerto Bustillo y termina en un mirador en la cumbre del cerro, desde donde se puede observar parte del Lago Futalaufquen, Cordón Situación y Valle del Río Desaguadero. Presenta una alta dificultad de ascenso.

Sendero al Lago Kruger: es una caminata de 12 horas de ida que parte desde Puerto Limonao y termina en el Lago Kruger, donde está permitido acampar. La dificultad que presenta es media-baja.

Sendero al arroyo Cascada: es un senderos que lleva cuatro o cinco horas recorrerlo partiendo desde Villa Futalaufquen y realiza un circuito por la ladera este del Cordón Situación, pasando por varios miradores. El recorrido termina en la misma Villa Futalaufquen. La dificultad que presenta es media-baja.

Sendero a la Laguna Escondida: es una ascensión de 4 horas de duración que nace en río Arrayanes y culmina en la Laguna Escondida. Presenta una dificultad media.

Sendero al Cerro Alto el Petiso: la ascensión es de seis o siete horas. Partiendo desde Pto. Mermoud, a orillas del Lago Verde y llega hasta la cumbre del cerro. Presenta alta dificultad de ascenso.